肿瘤防治研究  2015, Vol. 42 Issue (11): 1067-1070
本刊由国家卫生和计划生育委员会主管,湖北省卫生厅、中国抗癌协会、湖北省肿瘤医院主办。
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文章信息

陈宇,黄欣,刘思初,杨力建,陈少华,罗更新,李扬秋.
CHEN Yu, HUANG Xin, LIU Sichu, YANG Lijian, CHEN Shaohua, LUO Gengxin, LI Yangqiu.
下调PPP2R5C表达对Jurkat细胞GSK-3β、MDM2、pTEN、TP53通路相关调控基因表达谱的影响
Effects of PPP2R5C Downregulation on Expression Profile of GSK-3β, MDM2, pTEN and TP53 Signal Pathway Regulating Genes in Jurkat Cells
肿瘤防治研究, 2015, 42(11): 1067-1070
Cancer Research on Prevention and Treatment, 2015, 42(11): 1067-1070
http://www.zlfzyj.com/CN/10.3971/j.issn.1000-8578.2015.11.002

文章历史

收稿日期: 2014-11-14
修回日期: 2015-03-19
下调PPP2R5C表达对Jurkat细胞GSK-3β、MDM2、pTEN、TP53通路相关调控基因表达谱的影响
陈宇1,2,3, 黄欣1, 刘思初2, 杨力建2, 陈少华2, 罗更新2, 李扬秋2,3    
1. 510080广州,广东省人民医院医学研究中心,广东省医学科学院
2. 510632广州,暨南大学血液病研究所
3. 510632广州,暨南大学再生医学教育部重点实验室
摘 要:目的 利用基因芯片技术研究RNA干扰下调PPP2R5C对Jurkat细胞中GSK-3β、MDM2、pTEN、TP53通路相关基因表达的影响。方法 利用核转染技术将PPP2R5C-siRNA799转导Jurkat细胞,培养48 h后,提取细胞总RNA,纯化mRNA后反转录制备目标序列,与Affymetrix基因表达谱芯片3’IVT杂交,以Affymetrix GeneChip Scanner 3000扫描仪扫描得到原始图像数据,并应用GeneSpring GX 11.0软件进行差异表达谱分析。结果 基因芯片分析GSK-3β、MDM2、pTEN、TP53信号通路相关的47个基因,发现全部基因发生了差异表达,其中上调基因有22个,下调基因有25个。明显上调的基因有SNAI1、APC、CDKN1A、ATM、MDM2pTEN,而明显下调的基因只有GSK-3β结论 下调Jurkat细胞PPP2R5C基因时,在一定程度上选择性调节涉及细胞增殖和凋亡相关的GSK-3β、MDM2、pTEN和TP53信号通路基因的表达,从而抑制Jurkat细胞增殖。
关键词: PPP2R5C基因     基因芯片     核转染     GSK-3β     MDM2     pTEN     TP53    
Effects of PPP2R5C Downregulation on Expression Profile of GSK-3β, MDM2, pTEN and TP53 Signal Pathway Regulating Genes in Jurkat Cells
CHEN Yu1,2,3, HUANG Xin1, LIU Sichu2, YANG Lijian2, CHEN Shaohua2, LUO Gengxin2, LI Yangqiu2,3    
1. Medical Research Center, Guangdong General Hospital, Guangdong Academy of Medical Sciences, Guangzhou 510080, China;
2. Institute of Hematology, Medical College, Ji’nan University, Guangzhou 510632, China;
3. Key Laboratory for Regenerative Medicine, Department of Education, Ji’nan University, Guangzhou 510632, China
Abstract: Objective To analyze the influence of PPP2R5C downregulation by RNA interference on genes expression related to GSK-3β, MDM2, pTEN and TP53 signaling pathways in Jurkat cells. Methods PPP2R5C-siRNA799 was delivered into Jurkat cells by nucleofection. Total RNA was isolated from treated Jurkat cells at 48h after siRNA delivery. The target sequences were prepared after mRNA purification, and were hybridized with Affymetrix gene expression profile chip 3’IVT. The original image data were collected by Affymetrix GeneChip Scanner 3000 and analyzed the gene expression profile using Gene Spring GX 11.0 software. Results The expression of 47 genes related to GSK-3β, MDM2, pTEN and TP53 signaling pathway were changed, in which 22 genes were upregulated, while 25 genes were downregulated in PPP2R5C-siRNA799-transfected Jurkat cells. Significantly upregulated genes were SNAI1, APC, CDKN1A, ATM, MDM2 and pTEN, while significantly downregulated gene was identified on GSK-3β. Conclusion PPP2R5C downregulation inhibits Jurkat cells proliferation, which may relate to selective regulation of the genes expression of GSK-3β, MDM2, pTEN and TP53 signaling pathways.
Key words: PPP2R5C gene     Gene microarray     Nucleofection     GSK-3β     MDM2     pTEN     TP53    
0 引言

PPP2R5C是蛋白磷酸酶2A的一个调节亚单位,在调节细胞增殖、转化和凋亡中起重要作用,其表达模式的改变可能与细胞恶性转化有关[1, 2, 3]PPP2R5C基因定位于14q32.2,在人体中有五种拼接体表达,分别是B56γ1~B56γ6。我们前期研究发现,PPP2R5C在多种白血病细胞中过表达[4],而下调PPP2R5C可明显抑制白血病细胞K562和Jurkat细胞的增殖[5, 6],同时,我们初步发现其抑制作用与TCR、Wnt、Ca2+和MAPK等信号通路相关[6]。本研究进一步分析PPP2R5C-siRNA下调Jurkat细胞PPP2R5C后,与细胞凋亡密切相关的GSK-3β(glycogen synthase kinase 3 beta)、MDM2(Mdm2 p53 binding protein homolog)、pTEN(phosphatase and tensin homolog)和TP53(tumor protein p53)信号通路相关基因的变化情况,进一步明确PPP2R5C在白血病细胞增殖和凋亡中的相关分子机制。

1 材料与方法 1.1 细胞培养

T细胞白血病细胞株Jurkat为本室引进的细胞株,培养条件为:RPMI1640培养液(美国Gibco公司)含有10%胎牛血清(美国HyClone公司),加青霉素(苏州二叶制药有限公司)链霉素(山东鲁抗医药股份有限公司)双抗培养。培养于5%CO2、37℃培养箱(美国Thermo公司),2~3天换液传代一次。

1.2 核转染Jurkat细胞

实验分组分为siRNA转染组和空白对照NC组。siRNA转染组:收集2.5×106个处于对数生长期的Jurkat细胞,1 100 r/min离心10 min,完全去除上清液;采用核转染试剂盒Suspension cell lines NucleofectorTM Kit L(德国Amaxa公司)中100 μl预热至室温的NucleofectorTM溶液和Supplement混合液(9:2,即配即用)悬浮细胞;加入1 μl PPP2R5C-siRNA799(美国Invitrogen公司化学合成,发明专利:ZL201110340411.1),核转染专用的移液管混匀后加入核转杯,启动NucleofectorTM核酸转染仪(德国Amaxa公司)特异性程序X-001,转染完成后立刻用核转染试剂盒里配套的移液管将转染后的细胞液,接种于含培养液的培养瓶中继续培养48 h。NC组:Jurkat细胞不做处理培养48 h。

1.3 RNA提取

应用TRIzol试剂盒提取siRNA转染组和NC对照组Jurkat细胞的总RNA。提取后的RNA在100 V、体积分数为2%的琼脂糖凝胶中进行电泳并初步分析其质量。

1.4 Affymetrix基因表达谱芯片

Affymetrix基因表达谱芯片采用上海伯豪生物技术有限公司Affymetrix GeneChip Scanner 3000扫描仪扫描得到原始图像数据,并应用GeneSpring GX 11.0软件进行差异表达谱分析,最后用SBC分析系统进一步分析其相关信号通路。

2 结果 2.1 RNA质控结果

利用核转染技术转导PPP2R5C-siRNA799的Jurkat细胞,经细胞培养后,提取RNA得到siRNA转染组和NC对照组总RNA。所提取的各组样本RNA经Agilent 2100 Bioanalyzer生物分析仪分析,显示RNA A260/A280均在1.8~2.0之间,RNA分子完整数(RNA integrity number, RIN)值分别为8.9和8.1,且28S/18S分别为1.5和1.2,符合表达谱芯片试验要求(表达谱芯片样本质控要求为RIN≥7.0且28S/18S>0.7)。

2.2 芯片分析结果

Affymetrix基因表达谱芯片分析显示:经过PPP2R5C-siRNA799处理的Jurkat细胞有963个明显上调(439个)和下调(524个)的基因[6]。所涉及的信号通路较多,我们前期研究已探讨了下调PPP2R5C后涉及T细胞活化信号通路TCR(T-cell receptor signaling pathway)、Wnt(Wnt/β-catenin signaling pathway)、Ca2+(calcium signaling pathway)和MAPK(mitogen-activated protein kinase signaling pathway)信号通路改变情况[6]。然而,这些变化仍不能完全了解下调PPP2R5C后Jurkat细胞的变化特点。

本研究进一步分析下调PPP2R5对Jurkat细胞中涉及细胞增殖和凋亡GSK-3βMDM2pTENTP53信号通路相关的47个基因的影响情况。我们发现这4个信号通路中,上调基因有22个,下调基因有25个,其中基因上调、下调倍数小于2倍的分别有16个和24个,大于2倍的分别有6个和1个。上调倍数大于2倍的基因有SNAI1、APC、CDKN1A、ATM、MDM2pTEN,下调倍数大于2倍的基因只有GSK-3β。MDM2pTEN基因自身分别上调了16.5倍和2.76倍,GSK-3βTP53下调2.19倍和1.69倍、其余基因上调、下调倍数均为1倍左右,见图 1。将这些基因的芯片扫描数据均一化后,再经SBC系统分析后得到热图,见图 2

A: GSK-3β signaling pathway; B: MDM2 signaling pathway; C: pTEN signaling pathway; D: TP53 signaling pathway 图 1 下调PPP2R5C后Jurkat细胞中GSK-3β、MDM2、pTEN、TP53信号通路相关基因表达倍数图 Figure 1 Expression of genes related to GSK-3β, MDM2, pTEN and TP53 signaling pathways after PPP2R5C knockdown in Jurkat cells
Notes: 0, 1, 2, 3, -1, -2, -3: The Log values of upregulated or downregulated multiples with genes which corresponds to the color represented; NC: Normal Control 图 2 下调PPP2R5C后Jurkat细胞中GSK-3β、MDM2、pTEN、TP53信号通路相关基因改变热图 Figure 2 Expression of genes related to GSK-3β, MDM2, pTEN and TP53 signaling pathway after ppp2r5c knockdown in Jurkat cells analyzed by microarray technology
3 讨论

GSK-3β(glycogen synthase kinase 3 beta)是一种多功能的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,具有多种活性调节方式,并参与众多信号转导通路,调节细胞的生长、分化、增殖和凋亡。在肿瘤细胞中,已经证实其主要在癌细胞转录、加速细胞周期、参与肿瘤细胞侵袭与转移及凋亡过程中起到调控作用。TP53(tumor protein p53)又称为p53,作为一个肿瘤抑制基因而广为所知,其介导的细胞信号转导途径在调节细胞正常生命活动中起重要作用,活化的p53蛋白通过调控下游基因,诱导细胞周期停滞、细胞凋亡、DNA修复和衰老来抑制肿瘤细胞的恶化[7]。细胞正常生长情况下p53处于一个低表达水平,它的激活会受到MDM2的活化抑制[8]。MDM2(murine double minute 2)最初是在转化的成纤维细胞中发现的,编码一种锌指蛋白,可与p53蛋白结合,抑制p53介导的转录活性和阻止p53诱导凋亡的作用,引起肿瘤发生。除此之外,MDM2还可以与p21蛋白结合参与调节细胞增殖和凋亡。下调MDM2表达,p21蛋白表达就相应增加,导致细胞周期阻滞,并提高肿瘤细胞的化学敏感度[9]pTEN(phosphatase and tensin homolog deleted on chromosome ten)是一种抑癌基因,在细胞生长、凋亡、黏附、迁移、浸润等方面具有重要作用[10]。据以往文献报道[8, 9, 10, 11, 12],与GSK-3β、MDM2、pTENTP53相关的基因众多,其中MDM2、CDKN1A、TP53ATM与4个通路均相关,基于上述几个信号通路在细胞增殖和凋亡中的作用,本研究进一步从下调PPP2R5C表达后Jurkat细胞表达谱基因芯片结果中分析GSK-3β、MDM2、pTENTP53相关基因表达谱特点,非常明显的变化是下调PPP2R5C表达后,Jurkat细胞中涉及GSK-3β、MDM2、pTENTP53相关的全部47基因表达水平均发现变化,超过2倍上、下调基因有SNAI1、APC、CDKN1A、ATM、MDM2、pTENGSK-3β等7个基因。提示在下调PPP2R5C时,对Jurkat细胞中上述通路基因的影响存在一定的选择性,同时也提示这些基因的上调、下调参与了与调控PPP2R5C相关的细胞增殖抑制。下调PPP2R5C后,MDM2明显上调(16.5倍),而P53下调(1.69倍)处于一个低表达水平,细胞增殖得到抑制,这反向验证了MDM2抑制剂可以有效的提高P53活化水平和细胞凋亡率[11],同时也一定程度验证了PPP2R5C主要是通 过介导P53蛋白上的变化而发挥作用的[2, 12]。本结果初步提示下调PPP2R5C基因可能通过MDM2P53基因来调控影响肿瘤细胞相应的信号通路,从而起到抑制细胞增殖和凋亡的作用,使细胞回到正常的生长状态,还有待进一步的验证。下调PPP2R5C后,ATM明显上调(2.74倍),TP53下调(1.69倍),这一定程度上反向验证了DNA损伤后,ATM磷酸化可以定向调节PPP2R5C表达,而PPP2R5C磷酸化又可以激活P53的肿瘤抑制功能[13]SNAI1是一个转录调节因子,上调了2.0 7倍;CDKN1A是细胞周期抑制因子,上调了2.41倍,而CDKN1A基因又是SNAI1蛋白的抑制靶点[14],提示下调PPP2R5C基因可能主要在转录水平促进一些细胞周期抑制基因的转录、表达来抑制细胞的增殖。CDKN1A基因编码P21蛋白[12],P53下调,CDKN1A(P21)上调,细胞增殖受到抑制,这结果正好与文献报道的P53蛋白Thr55发生去磷酸化会促进P21的表达,从而抑制细胞增殖和转化相一致[15]。综上所述,下调Jurkat细胞PPP2R5C基因可以一定程度抑制TP53基因的功能,并同时促进其相关的CDKN1A和MDM2这些基因的协同作用,可能是发挥抑制Jurkat细胞增殖的效应所在。本研究结果主要在于首先提供了在白血病T细胞中PPP2R5C与GSK-3β、MDM2、pTENTP53信号通路之间的相关性,后续研究将挑选其他细胞株对这一结论做进一步的论证工作,也为发现协同靶向抑制T细胞肿瘤提供更系统资料。

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