2.伊犁友谊医院消化内科;
3.新疆 生产建设兵团农四师医院消化内科
2.Department of Gastroenterology, Friendship Hospital of Yili;
3.Department of Gastroenterology,The Fourth Hospital of Xinjiang Production and Construction Corps
我国是食管癌发病率和死亡率最高的国家, 新疆是我国食管癌高发区之一,而在新疆居住的 13个民族中哈族食管癌的发病率(155.9/10万)[1] 和死亡率(68.88/10万)[2]均高于其他民族。目前 认为哈族食管鳞癌的高发主要与其特殊的饮食生 活习惯如大量饮酒、喝热奶茶、酸奶疙瘩、饮食 快、饮食粗糙等相关[3]。
smad4基因是由Hahn发现的[4],该基因是定位 于胰腺癌染色体18q21.1上的一种抑癌基因。抑癌 基因启动子区CPG岛发生高甲基化是基因失活的 重要机制,而基因失活可导致肿瘤的发生[5]。 1 资料和方法 1.1 临床资料
组织标本来源于2009年1月—2011年12月新疆 哈萨克自治州新源县人民医院就诊的食管癌患者, 由新疆石河子大学医学院第一附属医院经内镜病 理诊断为食管鳞癌,其中哈族食管鳞癌和正常食 管组织分别为37和33例;汉族食管鳞癌和汉族正常 食管组织分别为31和33例。所有患者均未行放 、 化疗和手术治疗。其中男66例,女68例,年龄分布 30~80岁,中位年龄55岁。组织学分级高、中、低 分化食管鳞癌分别为21、25、22例。 1.2 方法 1.2.1 引物设计
内参β-actin引物由上海生工生物 有限公司设计合成,甲基化引物使用Sequenom公 司Epidesigner设计软件对smad4基因启动子区CpG 片段扫描、设计引物。引物扩增片段为320bp,见 表 1。引物序列用PCR扩增,在正向引物5’端加入 10mertag,用于平衡PCR反应条件;反向引物5’端 加入T7-Promoter 序列,用于后续的体外转录。
取50 mg组织标本,研磨成粉末 状,加入裂解液、蛋白酶K等,56℃过夜,第二天用 QIAGENDNA提取试剂盒提取DNA并收集约50μg DNA样本,内参β-actin用于检测DNA,所有DNA应 用分光光度计定量,电泳主带明显没有降解,浓度 高于75ng/μl,总量不小于2μg,A260/A280=1.7~2.1,质 检合格DNA样本于-20℃冰箱保存,见图 1。
1-8:esophageal squamous cell carcinoma tissues of the Kazaks
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DNA样 本亚硫酸处理应用EZDNAMethylation-GoldKit, ZYMO试剂盒,PCR扩增应用PCR Accessory Set试 剂盒,将5'-primer-(T7)primer混合成primerMAX使 用,终浓度为1μmol/L。 1.2.4 碱性磷酸酶处理及体外转录、RNase酶切、 纯化、点样及质谱分析
应用MassCLEAVEKit 试剂盒对样本进行碱性磷酸酶处理及体外转录 和RNase酶切。应用MassARRAYNanodispenser RS1000点样仪将纯化后的产物点至3 8 4格式 的Spectr oCHI P芯片上,最后将芯片放入Mass ARRAY Compact System进行检测。SpectroCHIP芯 片使用MALDI-TOF基质辅助激光解吸附电离飞行 时间质谱分析技术,通过EpiTYPER软件完成数据 分析。 1.3 统计学方法
应用SPSS17.0统计学软件对数据进行分析, 两独立样本Wilcoxon秩和检验对两样本间甲基化 率进行比较,P<0.05为差异有统计学意义。 2 结果 2.1 食管癌组织smad4基因启动子区总体平均甲基 化率的比较
汉族食管癌组和对照组、哈族食管癌组和对 照组中smad4基因启动子区平均甲基化率分别为 3.4%和2.8%(P=0.488)、3.4%和2.5%(P=0.271),差 异均无统计学意义。 2.2 食管癌组织smad4基因启动子区不同CPG位点甲基化率比较
smad4基因启动子区CpG-15、CpG-27的平 均甲基化率在汉族食管癌中(4.7%、4.9%)明 显高于正常对照组(2.8%、3.5%)(P=0.018、 0.045);CpG- 1、CpG- 16- 19、CpG- 27- 28、 C p G - 3 1 - 3 3在哈族食管癌中的平均甲基化率 (1.7%、4.5%、4.9%、6.8%)明显高于正常对照组的(0.7%、2.2%、3.0%、5.5%)(P=0.028、 0.001、0.007、0.012),CpG-6在哈族食管癌中 的平均甲基化水平(1.9%)明显高于汉族食管癌 (0.4%)(P=0.000);CpG-14在哈族正常组织 中的平均甲基化水平(6.2%)与在汉族正常组织 中的甲基化水平也有差异(7.3%)(P=0.021); CpG- 6、CpG- 15、CpG- 16- 19、CpG- 27- 28、 Cp G- 3 1 - 3 3在哈族正常组织中的平均甲基化率 (1.1%、3.1%、2.2%、3.1%、5.5%)与在汉族食 管癌组织中的平均甲基化率的差异(0.4%、4.8%、 4.1%、4.9%、7.6%)也有统计学意义(P=0.035、 0.025、0.006、0.004、0.025),见表 2。
smad4基因在汉族、哈族食管鳞癌组织中的不 同的分化程度的平均甲基化率的差异有统计学意 义,且随分化程度增高甲基化率降低。但smad4基 因在汉族、哈族食管癌组织不同性别中的甲基化 率的差别没有统计学意义,见表 3~4。
遗传学和表观遗传学的改变是影响肿瘤形成 的两大机制,DNA甲基化是一种重要的表观遗传 学现象。DNA启动子区高甲基化存在于多种肿 瘤中,可作为肿瘤诊断、预防、治疗、预后判断 的指标[6,7,8]。在食管鳞癌中也存在多种基因的异常 甲基化,如P16、MGMT、Hmlh1、RASSF1A、 hMSH2、RIZ1 [9,10,11]等,均说明基因异常甲基化与 食管癌的发生有关。转化生长因子β(TGF-β)在 细胞的生长、增殖、分化、凋亡、基质产生、肿 瘤形成等过程中均起着重要的作用,TGF-β/smad 信号传导通路能通过抑制肿瘤细胞增殖从而抑制 肿瘤的发生、发展[12],smad4基因表达产物smad4 蛋白是TGF-β/smad信号传导通路中的组成成分, smad4基因缺失或突变可引起肿瘤细胞逃避TGF-β 对肿瘤细胞增殖的抑制作用引起肿瘤的发生[13]。
本实验采用MassARRAY甲基化DNA定量分 析技术检测食管鳞癌组织中smad4基因的甲基化水 平,共分析了33个CpG位点,12个CpG单位。试验 结果中汉族食管癌组和对照组、哈族食管癌组和 对照组中smad4基因启动子区CpG位点的平均甲基 化率的差异不明显,但总体甲基化率之间的差异对试验结论的影响较小,总体中存在每个位点的甲 基化率,试验中研究的是个别位点的甲基化率。郭 炜[14]和董稚明[15]等分别对汉族贲门腺癌和食管鳞癌中 smad4基因甲基化状态进行分析,发现smad4基因在启 动子区发生了高甲基化并使smad4基因沉默,导致肿 瘤的发生,这与本试验结果相近。
汉族食管癌组织中smad4基因启动子区CpG-15、CpG-27的平均甲基化率(4.7%、4.9%) 明显高于对照组(2.8%、3.5%),表明这两个位点 的高甲基化可能与汉族食管鳞癌的发生有关,可以 作为汉族食管鳞癌的诊断标志物,可通过大样本 试验来判断其对汉族食管癌诊断的意义;CpG-1、 CpG-16-19、CpG-27-28、CpG-31-33的平均甲基化 率在哈族食管癌组(1.7%、4.5%、4.9%、6.8%) 明显高于哈族正常对照组(0.7%、2.2%、3.0%、 5.5%),故这四个位点的高甲基化可能参与了哈 族食管癌的发生;CpG-6在哈族食管癌和哈族正 常组织中的平均甲基化水平(1.9%,1.1%)均明显高 于汉族食管癌组(0.4%),CpG-15、CpG-16-19、 CpG-27-28、CpG-31-33的平均甲基化率在哈族对照 组(3.1%、2.2%、3.1%、5.5%)与在汉族食管癌组 (4.8%、4.1%、4.9%、7.6%)的差异也有统计学意 义。故CpG-6的高甲基化可能参与了哈族食管癌的 发生,是哈族食管鳞癌的高危因素,可能是哈族较 汉族食管鳞癌高发的关键性原因之一。因为哈族食 管鳞癌高发,那么理论上就可能会存在某个CpG位 点的甲基化率在哈族食管鳞癌组或哈族对照组中较 在汉族食管组织中高,本试验中发现的CpG-6很可 能是哈族smad4基因特异的高甲基化位点之一,这一 发现若得到证实将对哈族食管癌患者有重要意义。
smad4基因在汉族、哈族食管鳞癌组织中不同 分化程度的平均甲基化率差异有统计学意义,且随 分化程度增高甲基化率降低;smad4基因在汉族、 哈族食管癌不同性别中甲基化率差别没有统计学意 义。故smad4基因启动子区高甲基化不仅参与了食 管鳞癌的发生,还可能与食管鳞癌的发展有关系, 可作为食管鳞癌诊断及治疗的指标。由于试验时间 有限,目前随访工作正在进行,smad4基因是否可 以作为食管鳞癌预后监测的指标尚需继续验证。
研究发现甲基化是可逆的,因此应用去甲基化 剂来抑制癌细胞的增殖成为治疗食管鳞癌的新方 法。CpG-6对哈族食管鳞癌高发的原因研究中有重 要意义,需进一步探索研究。随着对肿瘤抑制基因 启动子区甲基化研究的深入,找到与食管鳞癌密切 相关的基因对食管鳞癌患者的预防、诊治、指导放 化疗及新药的开发等方面均有很大意义。
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