肿瘤防治研究  2014, Vol. 41 Issue (10): 1144-1147
本刊由国家卫生和计划生育委员会主管,湖北省卫生厅、中国抗癌协会、湖北省肿瘤医院主办。
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文章信息

何小婷,赵丽. 2014.
HE Xiaoting, ZHAO Li. 2014.
白血病微小残留病的检测及相关治疗中DNA甲基化的研究进展
Progress of DNA Methylation in Minimal Residual Disease Detection and Related Therapy for Leukemia
肿瘤防治研究, 2014, 41(10): 1144-1147
Cancer Research on Prevention and Treatment, 2014, 41 (10): 1144-1147
http://www.zlfzyj.com/CN/10.3971/j.issn.1000-8578.2014.10.019

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收稿日期:2013-09-02
修回日期:2013-11-29
白血病微小残留病的检测及相关治疗中DNA甲基化的研究进展
何小婷, 赵丽    
730000 兰州,兰州大学第一医院中心实验室
摘要:DNA甲基化异常在恶性肿瘤中是一种最常见的表观遗传学改变,它在基因表达调控、基因组 稳定性中起着重要作用,与白血病的发生、发展密切相关。肿瘤相关基因甲基化状态的分析可作为一 种生物标志物用于白血病微小残留病的检测及复发风险的评估。因此,诱导抑癌基因去甲基化在抗肿 瘤药物研究中具有重要意义。本文就近年来在DNA甲基化与白血病发生的关系及白血病去甲基化相关 治疗的研究进展作一综述。
关键词DNA甲基化     白血病     微小残留病     去甲基化    
Progress of DNA Methylation in Minimal Residual Disease Detection and Related Therapy for Leukemia
HE Xiaoting, ZHAO Li    
Central Laboratory, The First Hospital of Lanzhou University, Lanzhou 730000, China
Abstract:Aberrant DNA methylation is one of the most common epigenetic changes in malignant tumor. It plays an important role in gene expression regulation and genome stability, which are closely correlated with the initiation and progression of leukemia. The analysis of DNA methylation of tumor-related genes may be served as a biomarker for detecting minimal residual disease and assessing the risk of recurrence of leukemia. Thus, it would be important to induce demethylation of tumor suppressor gene in researching anti-tumor drug. This review focuses on the relationship between DNA methylation and initiation of leukemia, and the research advances of demethylation-related therapy for leukemia.
Key words: DNA methylation     Leukemia     Minimal residual diseasel(MRD)     Demethylation    
0 引言 白血病是一种造血干细胞的恶性克隆性疾病, 是导致儿童及35岁以下成年人死亡的最主要恶性肿 瘤,早期诊断、治疗及疾病监测至关重要。随着对 白血病发病机制的深入研究和治疗方案的改进,白 血病的完全缓解率得到较大提高,但其复发及耐药 问题也日益突出,严重影响化疗效果[1]。近年来研究 发现,白血病的复发与微小残留病(minimal residual disease,MRD)密切相关[2]。微小残留病是指经过诱 导治疗达到完全缓解时,患者体内残存的少量白血病 细胞。MRD是白血病复发的根源,MRD升高可提前 预示恶性血液病的全面复发,因此定期监测MRD, 对白血病的治疗和预后判断具有至关重要的意义。 MRD检测主要包括遗传学、分子生物学及免疫学的 特征,但很多患者并不具备相关的预后指标。随着对 白血病发病机制的深入研究,表观遗传学的异常改 变在白血病发病中的作用显得愈发重要[3]1 DNA甲基化 表观遗传学研究内容主要包括DNA甲基化、 组蛋白修饰、染色质重塑、 RNA干扰及反义RNA 等。在哺乳动物中,DNA甲基化主要发生在二核 苷酸胞嘧啶(CpG) 第5位碳原子上,在DNA甲基转 移酶(DNMT)的作用下,CpG 二联体中的胞嘧啶环 5′位的氢被S-腺苷甲硫氨酸的活性甲基所取代,从 而转变成5′-甲基胞嘧啶 (5-mC)。DNA甲基化主要 通过两种甲基转移酶的作用来完成:一类是重新 甲基化的甲基转移酶DNMT3a 和DNMT3b,另一 类是维持甲基化的甲基转移酶DNMT1。表观遗传 学研究证明DNA甲基化是一种基因外修饰,虽然 不改变DNA的一级结构,但在细胞正常发育、基 因突变、基因表达调控以及基因组稳定性中起着 重要作用,且这种修饰在细胞增殖过程中能稳定 传递,因此与肿瘤的发生密切相关。2 DNA甲基化异常与白血病的发生 DNA甲基化状态可影响基因结构和功能,某 些癌基因低甲基化和抑癌基因高甲基化是细胞癌 变的一个重要特征,在肿瘤的发生中起着极为重 要的作用。 在多种肿瘤中研究表明,肿瘤组织相对于正 常组织呈现普遍低甲基化状态。某些癌基因启动 子区域的去甲基化是肿瘤发生的早期事件,去甲 基化状态可能开放这些基因的转录从而上调基因 表达[4]。白血病细胞中特异性基因的低甲基化包括 BCL2、髓过氧化物酶、c-myc等。 大量研究发现,在肿瘤细胞中,很多肿瘤抑 制基因都是通过表观修饰使基因发生了沉默[4, 5]。 这些易感基因几乎涉及所有己知的细胞信息通 路,如控制细胞周期节点的生长调节因子(p15, p16,p73)[6, 7]、细胞凋亡因子(FHIT,DAPK)、细 胞间黏附因子(E-cadherin)等,这些基因与细胞生 长、基因调控密切相关,大部分是抑癌基因,其 启动子高甲基化抑制基因表达,与白血病的发生 密切相关。而且研究发现,在急慢性髓系白血病 中DNMTl、DNMT3a和DNMT3b的表达均有不同 程度的上调[8]。 Easwaran等[5]研究阐明了高甲基化与低甲基化 共存的机制,可能与不同酶的催化及染色质结构 的区域性改变有关。基因组整体低甲基化和区域 性高甲基化对不同基因有选择性的作用,抑癌基 因的高甲基化可抑制基因表达,而原癌基因的低 甲基化可能激活基因表达。 3 DNA甲基化在白血病MRD监测及预后评估中的作用 近期研究表明,某些特定基因甲基化异常是 肿瘤发生的早期事件,可作为恶性肿瘤早期诊断 及检测残存肿瘤细胞的标志。Stutterheim等[9]研究 表明,在神经母细胞瘤及乳腺癌、肺癌等恶性肿 瘤中,甲基化的RASSF1a是检测MRD的高度特异 性的DNA标志,而且适用于检测循环中的肿瘤细 胞。关于前列腺癌的研究中[10],PITX2基因高甲基 化的患者生物学复发风险增高,术后五年生存率 降低。在恶性血液肿瘤中,多种基因启动子区异 常甲基化与相应基因失活、MRD及预后有关。目 前研究表明,不同疾病状态下(初治、复发、完 全缓解)DNA甲基化水平与临床病情密切相关, 提示基因甲基化状态可作为一种独立的预后因素 评估肿瘤患者的复发风险。 目前p15基因甲基化与白血病的关系研究最为 深入。73%~93%的AML和57%的ALL患者发生 p15基因高甲基化,且持续p15基因高甲基化预示疾 病复发。与p15基因甲基化患者相比,非甲基化患 者无病生存期(disease-free survival,DFS)明显 延长。有研究对完全缓解期(complete remission, CR)的儿童AL患者检测p15基因甲基化状态,阳 性可预示疾病复发,阴性则预后较好[11],提示p15 基因甲基化检测对儿童白血病患者MRD的评估具 有重要价值。另有研究发现,在CR期的成人ALL 患者中,p73基因启动子区高甲基化与第一次CR 持续时间以及总生存期缩短之间有显著相关性。 Agrawal等[12]在AML患者中以ER-a、p15INK4B基因高 甲基化为MRD标志进行了研究,结果发现:60%和 63%缓解期AML患者存在p15INK4B和ER-a基因高甲 基化,与非恶性疾病患者检出率有显著差异,甲基 化水平升高预示着复发风险增高以及无复发生存率 降低。在缓解期的儿童ALL患者中,ER-a和p15INK4B 基因甲基化水平与Ig/TCR基因重排及随后的复发密 切相关。 有研究发现,ZO-1和ID4基因启动子区域异常 甲基化与多种恶性血液病MRD检测及预后评估具 有重要意义。ID4及ZO-1基因在健康人中呈低甲 基化状态,而在急性白血病患者中均呈甲基化状 态,并且在CR时仍存在高甲基化的恶性克隆。有 研究对CR期白血病患者检测以上两种基因甲基化 状态,MRD的检出率分别为34.6%和41%,并且两 种基因甲基化阳性的患者1年内复发率显著高于非 甲基化患者[13]。ID4及ZO-1基因甲基化检测同样适 用于多发性骨髓瘤(multiple myeloma,MM)患 者MRD的检测及预后评估[13]。 越来越多的证据表明,AL患者DNA甲基化水 平与病情进展及多种预后指标(CR持续时间、总 生存期、无复发生存期等)密切相关,并且与相应 的白血病肿瘤负荷有显著的正相关性,对于白血病 患者MRD的检测及预后评估具有重要价值。完全 缓解期甲基化检测可提前1~3月发现微小残留病, 预测疾病早期复发,具有白血病MRD检测标志的 潜质。ZO-1、ID4、ER-a和p15INK4B等基因甲基化状 态的分析可作为一种生物标志物用于MRD的检测 及复发风险的评估。由于DNA甲基化水平与已知的 遗传学指标变化趋势相一致,证实了甲基化水平作 为急性白血病检测指标的真实可行性。甲基化特异 性PCR(MS-PCR )技术作为一种高通量、高特异 度及敏感度的检测方法用于DNA甲基化的检测,可较为准确地检测MRD及预测疾病复发[14]4 DNA甲基化抑制剂在白血病治疗中的作用 由于在正常细胞中CpG岛的高甲基化状态并 不普遍,因此诱导去甲基化是药物治疗高度特 异性的靶点。目前已知的去甲基化药物主要为 DNMT抑制剂,包括5-氮杂胞苷(5-Azacytidine, 5 -Az a ) 、5 - 杂氮- 2 ′ - 脱氧胞苷( 5 - a z a - 2 ' - deoxycytidine)、三氧化二砷(As2O3)及反义寡 核苷酸抑制剂。研究表明去甲基化药物可以明显 延长肿瘤细胞的倍增时间,而对正常的原纤维细 胞没有影响。在不同的动物模型中都可以观察到 去甲基化药物可以阻止或逆转肿瘤的发生[15]4.1 5-氮杂胞苷 5-Aza是三核苷酸衍生物发生了磷酸化,进 而插入DNA中与DNMT结合,导致DNA合成早期 缺乏DNMT,进而发生基因去甲基化。实验证实 5-Aza可激活p16和其他甲基化的肿瘤抑制基因的 表达,并且在用于异基因造血干细胞移植(allo- SCT)后复发的AML及MDS患者时,其中位生存 期明显延长[16]。5-Aza现已被批准用于MDS低危及 高危患者的治疗,其三期临床试验证实5-Aza可改 善MDS患者骨髓象,使其白血病转化风险降低、 生活质量提高[17]4.2 5-杂氮-2′-脱氧胞苷 又称为地西他滨(decitabine,DAC),是一种 2′-脱氧胞苷类似物。DAC具有抗肿瘤活性且表现 为剂量相关的双重机制,高浓度时具有细胞毒作 用,低浓度时具有去甲基化作用。DAC被细胞摄 取后活化为DAC-TP,并插入细胞DNA中与DNMT 结合,从而使DNMT失去活性,导致相关基因的 去甲基化和重新表达,发挥治疗作用。Kopp等[18] 研究表明,低剂量DAC纠正NK细胞恶性基因表达 的表型,大剂量可能通过直接抑制mRNA的转录 来抑制NK细胞增殖。有研究利用DAC处理白血病 U-937/THP-1细胞后,PRAME基因表达呈剂量依赖 性地上调[19],并且与5-Aza相比,DAC的去甲基化 作用较强[20]。但由于DAC的毒性及水溶性不稳定, 限制了其临床应用。现已有一种胞嘧啶核苷类似物 zebularine,它是一种稳定的DNA甲基化抑制剂, 体内外毒性较小,可抑制细胞增殖,诱导凋亡,阻 滞细胞周期于G2/M期,而且与组蛋白去乙酰酶抑 制剂曲古抑菌素A(Trichostatin A)合用时,其基因 沉默效率及抑制细胞增殖的作用加强[21]4.3 三氧化二砷 (As2O3) As2O3治疗急性早幼粒细胞白血病取得令人 瞩目的成就,其作用机制主要为通过诱导白血病 细胞凋亡和分化、下调端粒酶活性等发挥抗癌作 用。然而,越来越多的研究发现,砷剂在其代谢 过程中需要通过甲基化被解毒,其代谢过程与癌 基因及抑癌基因的甲基化过程惊人地相似。研 究发现低浓度的As2O3可通过去甲基化作用上调 p16INK4a、RASSF1A、E-cadherin和GSTP1基因的 表达,而且对DNMT也具有抑制作用[22]。这提示 As2O3的确具有调控肿瘤细胞某些基因甲基化模式 的作用。所以,砷剂可作为又一种去甲基化药物 应用于临床。 4.4 DNMT1反义寡核苷酸抑制剂及siRNA 研究发现,DNMT1的反义寡核苷酸抑制剂或 siRNA敲除DNMT1可导致抑癌基因发生去甲基化 进而激活基因表达。DNMT1抑制剂在小鼠体内证 实可抑制肿瘤生长,临床试验中证实DNMT1抑制 剂在体内可引起DNA甲基化状态的改变,并且具 有抗肿瘤效应。大量数据表明DNMT蛋白是多功能 蛋白,除了催化DNA甲基化活性之外,还可以与 HDAC1、HDAC2及组蛋白甲基转移酶相互作用, 通过蛋白-蛋白之间相互作用抑制基因表达[23, 24]。 提示DNMT抑制剂的抗肿瘤活性除去甲基化作用之 外,还包括DNMT水平的降低及功能抑制。 大量研究表明抑制DNMT的活性具有抗肿瘤 效应,然而使用甲基化抑制剂是否会引起基因组 普遍性低甲基化呢?近期研究表明,DNMT1水平 降低可引起DNA复制的S期阻滞,DNA复制减慢 可保护基因组免于普遍性低甲基化[4]。目前已有 很多关于DNMT抑制剂的研究,这些药物可用于 白血病治疗的不同阶段:传统化疗之前或作为一 种维持治疗、在allo-SCT之前或移植复发之后[25]。 DNMT抑制剂在临床中的应用还需要大量临床试 验提供数据支持。 5 结语和展望 基于以上研究,对白血病患者进行表观遗传学 改变的分析,特别是对某些标志性基因甲基化状 态的分析具有至关重要的意义:(1)可以初步判 断患者预后,并鉴别某些预后不良的疾病亚型[26]; (2)运用MS-PCR技术检测微小残留病,突破了传 统检测方法的瓶颈,具有较高的特异性及敏感度, 对于监测白血病患者病情变化及预示复发具有重要 意义;(3)应用甲基化干预药物治疗白血病,为 设计新的化疗药物或联合化疗方案提供新的思路。
参考文献
[1] Shaffer BC, Gillet JP, Patel C, et al. Drug resistance: still a daunting challenge to the successful treatment of AML[J]. Drug Resist Updat, 2012, 15(1-2): 62-9.
[2] Paietta E. Minimal residual disease in acute myeloid leukemia: coming of age[J]. Hematology Am Soc Hematol Educ Program, 2012, 2012: 35-42.
[3] Krug U, Ganser A, Koeffler HP. Tumor suppressor genes in normal and malignant hematopoiesis[J]. Oncogene, 2002, 21(21): 3475-95.
[4] Szyf M. DNA demethylation and cancer metastasis: therapeutic implications[J]. Expert Opin Drug Discov,2008,3(5):519-31.
[5] Easwaran HP, Van Neste L, Cope L, et al. Aberrant silencing of cancer-related genes by CpG hypermethylation occurs independently of their spatial organization in the nucleus[J]. Cancer Res,2010,70(20):8015-24.
[6] Chim CS,Liang R,Kwong YL. Hypermethylation of gene promoters in hematological neoplasia[J]. Hematol Oncol, 2002, 20(4): 167-76.
[7] Chim CS, Liang R, Tam CY, et al. Methylation of p15 and p16 genes in acute promyelocytic leukemia: potential diagnostic and prognostic significance[J]. J Clin Oncol, 2001, 19(7): 2033-40.
[8] Wu SH, Zheng CP, Xu J, et al. Expression of DNMT gene in bone marrow of patients with acute myelogenous leukemia and its significance[J]. Zhongguo Shi Yan Xue Ye Xue Za Zhi, 2012, 20(5): 1063-5.[吴圣豪,郑翠苹,徐杰,等. 骨髓DNA甲基转移酶基 因在急性髓系白血病患者的表达及意义[J]. 中国实验血液学杂 志, 2012, 20(5): 1063-5.]
[9] Stutterheim J, Ichou FA, den Ouden E,et al. Methylated RASSF1a is the first specific DNA marker for minimal residual disease testing in neuroblastoma[J]. Clin Cancer Res, 2012, 18(3): 808-14.
[10] Weiss G, Cottrell S, Distler J,et al. DNA methylation of the PITX2 gene promoter region is a strong independent prognostic marker of biochemical recurrence in patients with prostate cancer after radical prostatectomy[J]. J Urol,2009,181(4):1678-85.
[11] Jiang JH, Shen JZ, Yan J, et al. Value of examining p15 gene methylation with methylation- specific PCR for diagnosing minimal resadual disease in childhood with acute leukemia[J]. Zhongguo Xiao Er Xue Ye Yu Zhong Liu Za Zhi, 2002, 7(1): 1-3.[蒋俊煌, 沈建箴, 严俊, 等. MSP检测p15基因甲基化在儿童急 性白血病微小残留病灶诊断中的价值[J]. 中国小儿血液与肿瘤 杂志, 2002, 7(1):1-3.]
[12] Agrawal S, Unterberg M, Koschmieder S, et al. DNA methylation of tumor suppressor genes in clinical remission predicts the relapse risk in acute myeloid leukemia[J]. Cancer Res,2007,67(3):1370-7.
[13] Tang HY, Wang XR, Wang LL, et al. Clinical significance of zo-1 and id4 gene abnormal methylation in multiple myeloma[J]. Zhongguo Shi Yan Xue Ye Xue Za Zhi, 2010, 18(5): 1192-7.[唐慧媛, 王新荣, 王莉莉, 等. Zo-1与id4基因异常甲基化在 多发性骨髓瘤中的临床意义[J].中国实验血液学杂志, 2010, 18(5):1192-7.]
[14] Zhao Y, Li HH, Bo J, et al. Investigation on MS-PCR as a method for detecting minimal residual disease in acute leukemia[J]. Zhongguo Shi Yan Xue Ye Xue Za Zhi, 2009, 17(2): 455-8. [赵瑜, 李红华, 薄剑, 等. 甲基化PCR作为白血病微量残留病检测方法 的探索[J]. 中国实验血液学杂志, 2009, 17(2): 455-8.]
[15] Zhang Q,Wang HY,Marzec M,et al. STAT3- and DNA methyltransferase 1-mediated epigenetic silencing of SHP-1 tyrosine phosphatase tumor suppressor gene in malignant T lymphocytes[J]. Proc Natl Acad Sci U S A,2005,102(19):6948-53.
[16] Czibere A, Bruns I, Kr?ger N,et al. 5-Azacytidine for the treatment of patients with acute myeloid leukemia or myelodysplastic syndrome who relapse after allo-SCT: a retrospective analysis[J]. Bone Marrow Transplant, 2010, 45(5): 872-6.
[17] Silverman LR, Mufti GJ. Methylation inhibitor therapy in the treatment of myelodysplastic syndrome[J]. Nat Clin Pract Oncol, 2005, 2 Suppl 1:S12-23.
[18] Kopp LM, Ray A, Denman CJ,et al. Decitabine has a biphasic effect on natural killer cell viability, phenotype, and function under proliferative conditions[J]. Mol Immunol, 2013, 54(3-4): 296-301.
[19] Ortmann CA, Eisele L, Nuckel H, et al. Aberrant hypomethylation of the cancer-testis antigen PRAME correlates with PRAME expression in acute myeloid leukemia[J]. Ann Hematol,2008,87(10): 809-18.
[20] Flotho C, Claus R, Batz C,et al. The DNA methyltransferase inhibitors azacitidine, decitabine and zebularine exert differential effects on cancer gene expression in acute myeloid leukemia cells[J]. Leukemia,2009,23(6):1019-28.
[21] Scott SA, Lakshimikuttysamma A, Sheridan DP,et al. Zebularine inhibits human acute myeloid leukemia cell growth in vitro in association with p15INK4B demethylation and reexpression [J]. Exp Hematol,2007,35(2):263-73.
[22] Cui X, Wakai T, Shirai Y,et al. Arsenic trioxide inhibits DNA methyltransferase and restores methylation-silenced genes in human liver cancer cells[J]. Hum Pathol, 2006, 37(3):298-311.
[23] Fuks F, Burgers WA, Brehm A,et al. DNA methyltransferase Dnmt1 associates with histone deacetylase activity[J]. Nat Genet, 2000, 24(1): 88-91.
[24] Fuks F, Burgers WA, Godin N, et al. Dnmt3a binds deacetylases and is recruited by a sequence-specific repressor to silence transcription[J]. EMBO J, 2001, 20(10): 2536-44.
[25] Thomas X. DNA methyltransferase inhibitors in acute myeloid leukemia: discovery, design and first therapeutic experiences[J]. Expert Opin Drug Discov, 2012, 7(11): 1039-51.